Sebuah survei genom dari jamur yang hidup di kulit kita memberikan kerangka untuk memahami bagaimana mikroba ini memberikan kontribusi untuk kesehatan kulit dan penyakit.
masyarakat yang kompleks mikroba hidup di permukaan tubuh kita. Ini jamur, bakteri dan virus secara kolektif dikenal sebagai microbiome kulit. Sebuah tim dari NIH National Human Genome Research Institute (NHGRI) dan National Cancer Institute (NCI) yang sebelumnya digunakan teknik genom untuk mempelajari bakteri kulit. Mereka menemukan komunitas bakteri yang beragam yang bervariasi antara orang dan oleh situs kulit. Dalam studi baru mereka, tim menggunakan pendekatan genomik yang sama untuk mendapatkan pemahaman yang lebih baik dari jamur yang hidup di kulit kita.
Jamur termasuk cetakan, jamur, dan ragi yang digunakan untuk fermentasi roti dan bir. mikroba ini telah dikaitkan dengan banyak penyakit kulit dan kondisi, termasuk kaki atlet, eksim, ketombe dan infeksi kuku. infeksi kulit jamur mempengaruhi sekitar 29 juta orang secara nasional. Tapi jamur bisa lambat dan sulit untuk tumbuh di laboratorium, membuat infeksi jamur sulit untuk mengidentifikasi dan mengobati.
Pada Mei 22, 2013, para ilmuwan mengumpulkan sampel di situs tubuh 14 dari orang dewasa sehat 10. Mereka memusatkan perhatian pada fragmen DNA yang dimiliki oleh semua jamur - interferetransmisi spacer 1 (ITS1) DNA ribosomial yang dapat digunakan untuk mengklasifikasikan jamur pada tingkat genus dengan akurasi 97 yang lebih besar.
Dengan menghasilkan lebih dari 5 juta rangkaian ITS1 dari sampel, tim tersebut dapat mengidentifikasi lebih dari jenis jamur tingkat gen 80 yang hidup di kulit manusia. Sebaliknya, metode kultur tradisional hanya bisa mengidentifikasi tipe 18. ditemukan di semua situs kulit. adalah tipe dominan pada 11 dari situs 14, termasuk di belakang telinga, di lubang hidung, di bagian belakang, dan di lengan.
Tim menemukan bahwa tumit, yang tidak menunjukkan keragaman bakteri yang luas, adalah situs yang paling kompleks untuk jamur, dengan tipe 80 terwakili. Jaring toe, dengan tipe 60, dan kuku kaki, dengan 40, memiliki tingkat keanekaragaman jamur tertinggi berikutnya. Tangan dan lengan, yang memiliki keragaman bakteri, memiliki tipe jamur yang relatif sedikit. Komunitas jamur di tubuh inti cukup stabil seiring berjalannya waktu, dengan sedikit perubahan saat diuji hingga terpisah 3 bulan. Sebaliknya, jamur di kaki berubah jauh selama bulan 3, mungkin mencerminkan lebih banyak paparan lingkungan.
Komunitas jamur di tubuh manusia kompleks dan spesifik lokasi, "kata penulis senior Dr. Heidi Kong dari NCI. Dengan mendapatkan kesadaran yang lebih lengkap tentang ekosistem jamur dan bakteri, kita dapat mengatasi penyakit kulit terkait dengan lebih baik, termasuk infeksi jamur, yang dapat dikaitkan dengan perawatan kanker.
Data dari penelitian kami memberi kami dasar tentang individu normal yang belum pernah kami alami sebelumnya, "kata penulis senior Dr. Julie Segre dari NHGRI. Intinya adalah kaki Anda penuh dengan keragaman jamur, jadi kenakan sandal jepit Anda di ruang ganti jika Anda tidak ingin mencampur jamur kaki Anda dengan jamur orang lain.
