Munculnya varian concern di penghujung tahun 2020 menandai pergeseran pandemi COVID-19. (Shutterstock)
Munculnya varian kekhawatiran di akhir tahun 2020 ini, seiring dengan pergeseran pandemi COVID-19 ketika “varian” memasuki leksikon publik. Percepatan varian Delta di seluruh dunia menimbulkan pertanyaan tentang asalnya, penularannya, titik panasnya, dan potensi resistensi vaksinnya.
Apa itu varian?
Melalui pengurutan genom, kita dapat menentukan urutan spesifik gen individu dan nukleotida yang membentuk untai DNA dan RNA. Jika kita menganggap virus sebagai sebuah buku, seolah-olah semua halamannya telah dipotong-potong. Sequencing memungkinkan kita untuk menentukan semua kata dan kalimat dalam urutan yang benar. Varian berbeda satu sama lain berdasarkan mutasi. Jadi, dua eksemplar buku akan menjadi "varian" jika satu atau lebih potongannya berbeda.
Kita juga harus menghargai bahwa varian telah muncul selama pandemi tanpa efek pada perilaku virus. Namun, munculnya varian yang menjadi perhatian, di mana mutasi telah mengakibatkan perubahan karakteristik virus (peningkatan penularan dan keparahan penyakit, penurunan efektivitas vaksin, kegagalan deteksi) memiliki konsekuensi kesehatan yang merusak.
Munculnya dan transmisi B.1.1.7 (Alpha), B.1.351 (Beta) dan P.1 (Gamma) di Kanada mengakibatkan gelombang transmisi ketiga menyebabkan sistem perawatan kesehatan kewalahan dan penerapan pembatasan lebih lanjut. Organisasi Kesehatan Dunia memperkenalkan sistem penamaan baru, berdasarkan alfabet Yunani, untuk varian virus corona pada musim semi 2021.
Dapatkan Terbaru Dengan Email
Apa varian Delta, di mana itu muncul?
Varian Delta adalah varian perhatian juga dikenal sebagai B.1.167.2 dan merupakan salah satu dari tiga sub-garis keturunan B.1.167 yang diketahui. Menurut Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit Amerika Serikat, varian Delta pertama kali terdeteksi di India pada bulan Desember 2020.
Organisasi Kesehatan Dunia memperkenalkan sistem penamaan baru, berdasarkan alfabet Yunani, untuk varian virus corona pada musim semi 2021. (Shutterstock)
Apa yang membuat varian ini berbeda dari varian lain yang menjadi perhatian?
Salah satu fitur yang menentukan varian Delta telah ditingkatkan transmisibilitasnya dengan peningkatan diperkirakan 40-60 persen di atas varian Alpha. Data terbaru dari Skotlandia menunjukkan bahwa risiko rawat inap dua kali lipat infeksi berikut dengan Delta (dibandingkan dengan Alpha), terutama pada mereka dengan lima atau lebih kondisi kesehatan lainnya. Peningkatan risiko rawat inap diamati dari data di Inggris.
Analisis epidemiologi, yang melihat hal-hal seperti distribusi infeksi dan tingkat keparahan penyakit, seringkali dapat memberikan penilaian cepat terhadap perubahan karakteristik virus. Mempelajari mutasi spesifik menggunakan analisis hubungan struktur-aktivitas, yang melihat bagaimana struktur kimia virus mempengaruhi aktivitas biologisnya, juga dapat memberikan petunjuk, meskipun validasi seringkali memakan waktu.
Protein spike (latar depan) memungkinkan virus masuk dan menginfeksi sel manusia. Pada model virus di latar belakang, permukaan virus (biru) ditutupi dengan protein lonjakan merah. (NIH), CC BY
Analisis hubungan struktur-aktivitas awal telah difokuskan pada hubungan tiga mutasi dengan perilaku Delta. Khususnya, sebuah studi pracetak yang belum ditinjau oleh rekan sejawat menyarankan bahwa tiga mutasi pada protein lonjakan SARS-CoV-2 dapat membuat varian lebih menular dengan mempermudah protein spike untuk mengikat reseptor di sel manusia (dikenal sebagai reseptor ACE2).
Jika kita kembali ke analogi buku, itu berarti tiga potongan potongan di buku versi Delta berbeda dari aslinya. Masing-masing dari tiga bagian ini dapat memudahkan virus menginfeksi sel manusia.
Apa yang kita ketahui tentang epidemiologi varian Delta dan titik panasnya?
Bukti menunjukkan itu Delta memainkan peran besar dalam lonjakan kasus COVID-19 yang diamati di India pada tahun 2021. Sejak itu, varian ini memiliki menyebar secara global. Pada 14 Juni, varian Delta telah terdeteksi di negara 74, terhitung lebih 90 persen kasus baru di Inggris, dan setidaknya enam persen dari total kasus di AS, dengan perkiraan sebagai setinggi 10 persen.
Banyak dari apa yang kita ketahui tentang varian Delta berasal dari Public Health Inggris. Varian Delta pertama kali terdeteksi di Inggris pada akhir Maret 2021, dan terkait dengan perjalanan. Pada 9 Juni, jumlah kasus yang dikonfirmasi atau kemungkinan adalah 42,323, dengan distribusi yang luas dan heterogen di seluruh Inggris
Di Kanada, Delta pertama kali terdeteksi pada awal April di British Columbia. Meskipun Alpha adalah varian garis keturunan yang paling dominan terdeteksi di Kanada, pertumbuhan Delta telah dipercepat di banyak provinsi. Data Alberta menunjukkan bahwa jumlah kasus adalah dua kali lipat setiap enam sampai 12 hari. Ontario memperkirakan itu 40 persen dari kasus barunya pada 14 Juni 2021 adalah karena Delta. Hasil pemodelan dari BC menunjukkan bahwa Delta akan secara signifikan berkontribusi pada lintasan keseluruhan dengan Agustus ini.
Penting untuk dicatat bahwa prevalensi yang dilaporkan Delta adalah perkiraan yang terlalu rendah karena tes skrining yang tepat waktu belum dikembangkan.
Apa yang kita ketahui tentang Delta dan vaksin?
Data menunjukkan bahwa vaksinasi memberikan perlindungan terhadap infeksi dan rawat inap dengan varian Delta. THE CANADIAN PRESS / Jonathan Hayward
Analisis awal dari Inggris tentang efektivitas vaksin terhadap varian Delta telah memberikan beberapa optimisme.
Data dari Skotlandia menunjukkan bahwa vaksinasi dengan AstraZeneca atau Pfizer mengurangi rawat inap dan infeksi, meskipun kurang dari varian Alpha. Namun, bukti menunjukkan bahwa imunisasi dua dosis dengan AstraZeneca atau Pfizer mengurangi rawat inap masing-masing sebesar 92 persen dan 96 persen. Perlindungan dari penyakit simtomatik berkurang 17 persen untuk Delta dibandingkan dengan Alpha dengan hanya satu dosis vaksin. Pengurangan sederhana dalam efektivitas terhadap penyakit simtomatik dicatat setelah dua dosis vaksin.
Penyebaran varian Delta telah membuat orang mendapatkan vaksinasi dengan dua dosis tujuan utama kebijakan kesehatan masyarakat, dan hasil ini mendukung itu. Namun, dosis pertama tampaknya memberikan perlindungan substansial dari penyakit parah yang membutuhkan rawat inap.
Tentang Penulis
books_health
