Seorang petugas kesehatan melakukan tes swab COVID pada seorang pasien. Ada beberapa alasan tes RT-PCR dapat menghasilkan hasil positif palsu. Shutterstock

Dua kasus COVID-19 yang sebelumnya terkait dengan wabah Melbourne saat ini kini telah direklasifikasi sebagai positif palsu.

Mereka tidak lagi dimasukkan dalam penghitungan kasus resmi Victoria, sementara sejumlah situs paparan yang terkait dengan kasus ini telah dihapus.

Tes utama dan “standar emas” untuk mendeteksi SARS-CoV-2, virus penyebab COVID-19, adalah tes reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR).

Tes RT-PCR sangat spesifik. Artinya, jika seseorang benar-benar tidak terinfeksi, ada kemungkinan besar hasil tesnya negatif. Tes ini juga sangat sensitif. Jadi, jika seseorang benar-benar terinfeksi virus, kemungkinan besar hasil tesnya akan positif.


grafis berlangganan batin


Tetapi meskipun tesnya sangat spesifik, masih ada kemungkinan kecil seseorang yang tidak terinfeksi memberikan hasil tes yang positif. Inilah yang dimaksud dengan "positif palsu".

Pertama, bagaimana cara kerja tes RT-PCR?

Meski di zaman COVID kebanyakan orang pernah mendengar tentang tes PCR, cara kerjanya dimengerti sedikit misteri.

Singkatnya, setelah swab diambil dari hidung dan tenggorokan, bahan kimia digunakan untuk mengekstrak RNA (asam ribunokleat, sejenis materi genetik) dari sampel. Ini terdiri dari RNA biasa dan RNA seseorang dari virus SARS-CoV-2, jika ada.

RNA ini kemudian diubah menjadi asam deoksiribonukleat (DNA) — inilah yang dimaksud dengan bit “reverse transcriptase”. Untuk mendeteksi virus, segmen kecil DNA diperkuat. Dengan bantuan beberapa pewarna fluoresen khusus, sampel diidentifikasi positif atau negatif berdasarkan kecerahan fluoresensi setelah 35 atau lebih siklus amplifikasi.

Apa yang menyebabkan hasil positif palsu?

Grafik alasan utama untuk hasil positif palsu adalah kesalahan laboratorium dan reaksi di luar target (yaitu, uji reaksi silang dengan sesuatu yang bukan SARS-CoV-2).

Kesalahan laboratorium termasuk kesalahan administrasi, pengujian sampel yang salah, kontaminasi silang dari sampel positif orang lain, atau masalah dengan reagen yang digunakan (seperti bahan kimia, enzim, dan pewarna). Seseorang yang telah memiliki COVID-19 dan pulih mungkin juga menunjukkan hasil positif palsu.

Seberapa umumkah hasil positif palsu?

Untuk memahami seberapa sering positif palsu terjadi, kita melihat tingkat positif palsu: proporsi orang yang diuji yang tidak memiliki infeksi tetapi mengembalikan hasil tes positif.

Penulis baru-baru ini pracetak (makalah yang belum ditinjau oleh rekan sejawat, atau diverifikasi secara independen oleh peneliti lain) melakukan tinjauan terhadap bukti tingkat positif palsu untuk tes RT-PCR yang digunakan untuk mendeteksi SARS-CoV-2.

Mereka menggabungkan hasil beberapa penelitian (beberapa melihat pengujian PCR untuk SARS-CoV-2 secara khusus, dan beberapa melihat pengujian PCR untuk virus RNA lainnya). Mereka menemukan tingkat positif palsu 0-16.7%, dengan 50% studi pada 0.8-4.0%.

Angka positif palsu dalam tinjauan sistematis terutama didasarkan pada pengujian jaminan kualitas di laboratorium. Kemungkinan dalam situasi dunia nyata, akurasi lebih buruk daripada di studi laboratorium.

A review sistematis melihat tingkat negatif palsu dalam pengujian RT-PCR untuk SARS-CoV-2 menemukan tingkat negatif palsu adalah 1.8-58%. Namun, mereka menunjukkan bahwa banyak penelitian berkualitas buruk, dan temuan ini didasarkan pada bukti berkualitas rendah.

Tidak ada ujian yang sempurna

Katakanlah misalnya, tingkat positif palsu dunia nyata adalah 4% untuk pengujian RT-PCR SARS-CoV-2.

Untuk setiap 100,000 orang yang dites negatif dan benar-benar tidak terinfeksi, kami berharap memiliki 4,000 positif palsu. Masalahnya adalah bahwa untuk sebagian besar dari ini kita tidak pernah tahu tentang mereka. Orang yang dites positif diminta untuk dikarantina, dan semua orang menganggap mereka memiliki penyakit tanpa gejala.

Ini juga dikacaukan oleh fakta bahwa angka positif palsu bergantung pada prevalensi penyakit yang mendasarinya. Dengan prevalensi yang sangat rendah seperti yang kita lihat di Australia, jumlah positif palsu dapat menjadi jauh lebih tinggi daripada jumlah positif sebenarnya, sesuatu yang dikenal sebagai paradoks positif palsu.

Karena sifat wabah Victoria saat ini, pihak berwenang kemungkinan akan ekstra waspada dengan hasil tes, yang berpotensi meningkatkan kemungkinan positif palsu diambil. Itu Pemerintah Victoria mengatakan:

Setelah analisis oleh panel peninjau ahli, dan pengujian ulang melalui Laboratorium Referensi Penyakit Menular Victoria, dua kasus yang terkait dengan wabah ini telah dinyatakan positif palsu.

Ini tidak menjelaskan apakah kedua orang itu diuji ulang, atau hanya sampel yang diuji ulang.

Either way, itu sial untuk memiliki dua positif palsu. Tetapi mengingat banyaknya orang yang dites setiap hari di Victoria saat ini, dan fakta bahwa kita tahu positif palsu akan terjadi, itu bukan hal yang tidak terduga.

Implikasi yang lebih luas

Bagi individu yang menerima hasil tes positif palsu, mereka akan dipaksa untuk dikarantina jika tidak diperlukan. Diberitahu bahwa Anda memiliki penyakit yang berpotensi mematikan sangat menegangkan, terutama bagi orang lanjut usia atau mereka yang berisiko karena kondisi kesehatan lainnya. Mereka juga kemungkinan akan khawatir menginfeksi anggota keluarga mereka yang lain, dan bisa kehilangan pekerjaan saat dikarantina.

Khususnya mengingat otoritas awalnya menunjuk ke dua kasus ini these sebagai contoh Dari penularan virus melalui kontak “sekilas”, tak pelak banyak orang bertanya-tanya apakah tanpa kasus ini, Victoria mungkin tidak akan lockdown. Ini hanya dugaan dan kita tidak bisa benar-benar tahu satu atau lain cara.

Hasil negatif palsu jelas sangat memprihatinkan, karena kami tidak ingin orang-orang menular berkeliaran di sekitar komunitas. Tapi positif palsu juga bisa bermasalah.

Tentang Penulis

Adrian Esterman, Profesor Biostatistik dan Epidemiologi, Universitas Australia Selatan

books_disease

Artikel ini awalnya muncul di Percakapan